反渗透膜是纯水设备中重要的组成件，若系统设计不合理或运行控制不当，必然会出现膜污染的情况。在膜污染的几种类型中(沉淀污染、微生物污染、胶体污染等)，微生物污染具有其特殊性，它在反渗透水处理中所造成的运行困难是最严重的一种。

反渗透膜在工作的过程中，低压冲洗的过程会产出一部分的淡水，但是两侧水的浓度会增加，含盐量就会增大，盐中含有很多可沉淀的物质，长久的堆积下去就会产生结垢的现象。我们在设计时，为了能够更好将反渗透浓水置换出来，就要尽可能保证浓水中含盐量少。另外，在加药时，药剂没有充分混合也是导致反渗透膜结垢的重要原因之一。

阻垢剂能够防止结垢现象的产生，但是如果加药装置漏药现象比较严重，就会导致加药量不够，处理效果不佳。

反渗透膜使用的过程中，操作步骤没有按照规定的要求没有引起足够重视，设备停机后没有及时进行清洗。